Адміністративно-управлінський відділ забезпечує організаційну та адміністративну діяльність центру крові
Відділ координує роботу структурних підрозділів, веде документообіг і кадрове діловодство, готує внутрішні розпорядчі документи. Також забезпечує організаційний супровід діяльності керівництва, контроль виконання управлінських рішень і взаємодію з державними установами та партнерами. 
Основним завданням відділу є створення ефективних умов для безперебійної роботи всіх служб центру крові.

Фінансово-економічний відділ забезпечує планування, облік і контроль фінансової діяльності центру крові
Відділ формує бюджет, здійснює фінансове планування, аналізує використання коштів та контролює економічну ефективність роботи закладу. Також готує фінансову звітність, проводить розрахунки, бере участь у формуванні кошторису та забезпечує дотримання вимог бюджетного законодавства.
Основним завданням відділу є ефективне управління фінансовими ресурсами для стабільної роботи центру крові.

Відділ комплектування донорських кадрів - забезпечує стабільне функціонування системи донорства крові та її компонентів.
Основні напрями роботи:Комплектування донорів крові, плазми та клітин крові, їх облік.Контроль стану здоров’я донорів, у тому числі під час карантинізації плазми (180 діб), а також своєчасне відведення осіб із тимчасовими чи постійними протипоказаннями.Ведення медичної документації та формування єдиного реєстру донорів.Подання кандидатів на звання «Почесний донор України».Регулювання потоку донорів для скорочення часу перебування у закладі.Обмін інформацією з медичними установами щодо виявлення інфекційних захворювань (ВІЛ, гепатити В і С, сифіліс тощо).Систематичний аналіз показників донорства та вдосконалення менеджменту якості.
Організаційна та просвітницька діяльність:Проведення акцій із заготівлі крові, розвиток корпоративного донорства.Співпраця з молодіжними, волонтерськими та громадськими організаціями, освітні лекції та зустрічі у вищих навчальних закладах.Популяризація донорського руху через засоби масової інформації та поширення інформаційних матеріалів.Формування та ведення реєстрів донорів із рідкісними групами крові.Анкетування та опитування донорів для покращення процесів у закладі.Відділ не лише забезпечує ефективний облік і безпеку донорів, а й активно сприяє розвитку культури донорства серед населення. Для комфортного перебування донорів у закладі передбачене забезпечення сніданком.

Лабораторний відділ забезпечує якісний лабораторний контроль донорської крові та її компонентів, а також проводить імуногематологічні дослідження для потреб пацієнтів закладів охорони здоров’я.

Основні напрями роботи:Попереднє обстеження кандидатів у донори: визначення рівня гемоглобіну, гематокриту, кількості тромбоцитів, групи крові (за допомогою моноклональних антитіл).Обстеження заготовленої донорської крові: визначення групи крові перехресним методом, визначення Резус фенотипу, К антиген системи Келл, антиретроцитарних антитіл та вмісту загального білка.

Скринінг на трансмісивні інфекції: перевірка донорської крові та її компонентів на ВІЛ 1/2, гепатити В і С, сифіліс серологічними методами (ІХЛА, ІФА), скерування позитивних результатів на верифікаційні дослідження відповідно до вимог МОЗ України, формування архіву зразків сироватки/плазми.

Імуногематологічні дослідження пацієнтів:визначення групи крові за системою АВО та резус у складних випадках, індивідуальний підбір крові донорів для реципієнтів, проведення прямої та непрямої проби Кумбса, фенотипування та скринінг антитіл.Робота зі стандартами: підбір сировини та забезпечення якості імунологічних стандартів.

Додаткові функції:Надання консультативної допомоги лікарям-клініцистам із питань ізосерології.Лабораторний відділ є ключовою ланкою безпеки трансфузій, адже саме тут забезпечується достовірність діагностики, якість донорської крові та правильність підбору компонентів для кожного пацієнта.

Відділ технологічного контролю (ВТК) створено з метою контролю показників безпеки та якості донорської крові, компонентів крові, процесів їх заготівлі, тестування, переробки, зберігання, розподілу та реалізації.Функції відділу включають проведення лабораторних досліджень, постійний моніторинг та оцінку заготівлі, тестування донації крові та/або компонентів крові незалежно від їх кінцевого призначення, а також контроль процесів переробки, зберігання розподілу, реалізації на відповідність стандартам і принципам які визначені в нормативно-правовій документації, а саме: Закон України «Про безпеку та якість донорської крові та компонентів крові» від 30.09.2020 р. № 931-ІХ, наказ МОЗ України від 02.05.2023 № 818 «Про внесення змін до наказу Міністерства охорони здоров’я України від 09 березня 2010 року №211», міжнародний стандарт EN ISO 9001:2015.
З 2017 року в закладі впроваджена ефективна Система управління якістю яка сертифікована відповідно до вимог національного стандарту ДСТУ ISO 9001:2015 "Система управління якістю. Вимоги". Система якості поширюється на всі етапи діяльності, охоплює організаційну структуру, процедури, процеси, ресурси тощо. Система управління якістю підтримується на належному рівні та постійно удосконалюється. Для провадження господарської діяльності, в рамках системи якості, затверджені внутрішні письмові методики виконання процесів, стандартні операційні процедури, інструкції тощо. Призначена відповідальна особа, яка координує діяльність, надає методичний, організаційний супровід для реалізації Політики якості КНП «Обласний центр крові» Житомирської обласної ради.

Господарський відділ забезпечує належний технічний стан будівель, приміщень, обладнання та прилеглої території центру крові
Відділ організовує своєчасний ремонт інженерних мереж і обладнання, усуває технічні та санітарно-гігієнічні недоліки, контролює дотримання вимог пожежної безпеки та облік протипожежного інвентарю. Також відповідає за проведення доброустрою й озеленення території, а також організовує навчання технічного й персоналу, що обслуговує з питань охорони праці та безпеки життєдіяльності. Основною метою роботи відділу є створення безпечних, комфортних і безперебійних умов для діяльності центру крові.

Відділ організації та трансфузіологічної допомоги забезпечує координацію потреб закладів охорони здоров’я області в донорській крові та її компонентах
Відділ аналізує потреби лікарень, здійснює планування заготівлі крові та компонентів крові, контролює їх використання і формування не знижувального запасу. Також надає консультативну допомогу медичним закладам щодо правильного клінічного застосування компонентів крові, проводить статистичний аналіз діяльності центру крові та бере участь у підготовці річних планів його роботи. 
Основним завданням відділу є забезпечення безперебійного, раціонального та безпечного функціонування системи трансфузіологічної допомоги в області.

Відділ інфекційного контролю забезпечує впровадження та контроль заходів, спрямованих на запобігання інфекціям на всіх етапах заготівлі, переробки, тестування, зберігання та транспортування донорської крові й її компонентів
Діяльність відділу ґрунтується на сучасних національних і міжнародних стандартах інфекційної безпеки та спрямована на захист здоров'я донорів, реципієнтів і працівників центру крові. Фахівці відділу контролюють дотримання санітарно-епідемічних вимог, правил гігієни рук, очищення та дезінфекції приміщень, обладнання і поверхонь, безпечного поводження з гострими медичними виробами та медичними відходами. Також відділ організовує профілактичні заходи серед персоналу, проводить внутрішній моніторинг, оцінку ризиків і навчання працівників сучасним принципам інфекційного контролю.
 Основною метою роботи відділу є забезпечення максимальної безпеки процесів служби крові, мінімізація ризику передачі інфекцій та підтримання високої якості й безпечності компонентів донорської крові.

Відділ заготівлі крові та її компонентів забезпечує повний цикл заготівлі донорської крові відповідно до сучасних стандартів якості та безпеки
Основною метою роботи відділу є забезпечення закладів охорони здоров’я якісними та безпечними компонентами крові для надання своєчасної допомоги пацієнтам. Фахівці відділу проводять донації у стаціонарних умовах і під час виїзних акцій, здійснюють заготівлю компонентів крові методом аферезу, а також забезпечують переробку цільної крові на еритроцитарні компоненти, плазму та тромбоцити. 
Усі етапи роботи — від донації до зберігання і видачі компонентів крові — здійснюються з дотриманням національних та міжнародних вимог, температурних режимів і принципів гемонагляду. Це гарантує простежуваність кожної донації, максимальну безпеку донорів і реципієнтів та високу якість компонентів крові.